Основные направления научных исследований, проводимых на факультете:

• математическое моделирование динамических процессов
• математическое моделирование на многопроцессорных вычислительных системах
• теория функций
• физика наноматериалов
• колебательная спектроскопия и квантовохимическое моделирование супрамолекулярных соединений
• исследование коррозионных и электрохимических свойств ультрамелкокристаллических структур и нанокристаллов
• изучение механизма электрокристаллизации покрытий металлами и сплавами с заданными свойствами при трибоактивности и в нестационарных условиях при получении модифицированных смазок и износостойких покрытий
• исследования закономерностей функционирования языкового механизма у человека
• асимптотический анализ дифференциальных уравнений
• исследование численных алгоритмов
• исследование особенностей и тенденций развития социальной стратификации населения РБ
• исторические исследования социально-экономических процессов, общественно-политической жизни и научно-технического развития в российских регионах актуальные вопросы истории и культуры Башкортостана на современном этапе
• преемственность в духовной жизни российского общества.

Научно-исследовательские лаборатории при подразделениях факультета:

• НИЛ молекулярной спектроскопии
• НИЛ математического моделирования
• НИЛ группового анализа математических моделей естествознания, техники и технологий
• Междисциплинарная НИЛ нефтепромысловой химии